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自然而然的癌症:只需6个指标就可以预测疗效,AI加持下的全新免疫治疗预测模型问世!  第1张

自然而然的癌症:只需6个指标就可以预测疗效,AI加持下的全新免疫治疗预测模型问世!  第2张

人工智能,能为人所不能为,近几年医疗领域的AI热潮里,“AI阅片”之类的成果就已经证明,AI有着追平甚至超越医护工作者的能力,有时更是能从已知信息中,挖掘出全新的未知可能性,来帮医生们解决临床上的老大难问题。


比如近日在《自然·癌症》期刊上,美国国家癌症研究所(NCI)和纪念斯隆-凯特琳癌症中心(MSKCC)研究团队就共同发表了最新研究成果,在AI技术的加持下,研究者们开发出了一种名为LORIS的免疫检查点抑制剂(ICB)疗效预测模型,这套模型仅需使用6个患者基线和临床特征,就足以在多种实体瘤中准确地预测治疗应答和患者生存[1]。


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论文核心内容总结


预测PD-1/L1抑制剂或是CTLA-4抑制剂治疗应答,这可真是奇点糕们一直在念叨、学界从未停止过探索的老大难问题,但近几年翻来覆去的各种探索,却很少有什么标志物能做到“尽善尽美”,所以像非小细胞肺癌(NSCLC)等热门瘤种里,主要倚仗的还是PD-L1表达水平和肿瘤突变负荷(TMB)这些老面孔,但它们的不足之处也明摆着。


所以在这次的研究中,NCI和MSKCC的研究团队定下了两个主要原则,其一就是选出能有效预测ICB疗效的标志物或患者特征,其二则是标志物或特征必须简单易得,方便临床使用,如果相关指标要靠多组学分析之类的手段才能获取,那就太不接地气了。


研究者们共分析了2881名接受ICB治疗(PD-1/L1抑制剂或CTLA-4抑制剂单药/联合治疗)和841名未接受ICB治疗患者的数据,涵盖18种实体肿瘤;评价ICB疗效的指标是客观缓解率(ORR)、无进展生存期(PFS)和总生存期(OS),此外还收集了20余种患者临床、病理和基因组学特征,其中8种覆盖了所有参与者(性别、年龄、系统性治疗史等)


接下来,研究者们使用20种不同的机器学习架构,基于上述患者特征综合构建并评估ICB的疗效预测模型(有泛癌模型和癌种特异性模型);而在8种所有患者资料均具备的特征中,患者性别和ICB类型在模型预测时影响最小,去除这两种特征后得到的最佳模型,是一个六特征逻辑最小绝对收缩和选择算子(LASSO)回归模型(LLR6),也就是LORIS模型。


被纳入LORIS模型的6个特征,按照重要顺序排列如下:TMB、系统性治疗史、血清白蛋白、血液中性粒细胞/淋巴细胞比值(NLR)、年龄和癌症类型,根据这些特征可计算得到LORIS评分(全称为:基于逻辑回归的免疫治疗反应评分),对治疗有应答患者的评分较高。经过多次验证,LORIS模型的表现明显优于单纯使用TMB预测,也整体优于2022年MSKCC团队借助AI提出的RF16预测模型[2],以及本次研究中机器学习的其它成果。


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LORIS模型获取过程的简介


这还不是LORIS模型的全部“过人之处”,接下来研究者们证实,LORIS模型可在TMB低表达患者中识别出一批经ICB治疗后,获益与TMB高表达患者相似的人群,这是现有标志物检测或模型预测还不容易做到的;在预测患者短期和长期生存预后方面,LORIS模型的表现均明显好于TMB检测,结论对模型构建时纳入的18种实体瘤也具有普适性。


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LORIS模型可在TMB低表达患者中检出ICB治疗潜在优势人群


而且,LORIS评分与患者接受ICB治疗后达到客观缓解的可能性也呈正相关(同时与OS也呈正相关),这就意味着在根据患者特征计算出LORIS评分后,临床医生可以借此预测疗效,特别是识别出最有可能达到客观缓解的前10%患者(达到客观缓解概率超过50%),同时排除最不可能达到缓解的约10%患者(概率低于10%)


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LORIS评分可用于预测患者实现客观缓解的概率


最后,还记得奇点糕们在研究开始之初提过,研究者们建模时也尝试了“癌种特异性模型”吗?LORIS模型还可以根据某个癌症的特点进行调整,例如用NSCLC免疫治疗常规检测的PD-L1表达水平(使用肿瘤细胞分数/TPS评估),替换原模型中的癌症类型这项特征,就取得了显著优于单纯检测PD-L1表达或TMB水平的预测准确性。


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“癌种特异性”LORIS模型可能更专精


现在NCI已经将LORIS模型做成了专门的网站,只需输入相关信息就能得到预测结果,这也算是临床医生们非常熟悉且友好的使用方式,奇点糕也推荐身在一线的读者们进行一些尝试,一起为免疫治疗预测模型的不断进步添砖加瓦嘛。


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LORIS模型在线评分网站


参考文献:

[1]Chang T G, Cao Y, Sfreddo H J, et al. LORIS robustly PRedicts patient outcomes with immune checkpoint blockade therapy using common clinical, pathologic and genomic features[J]. Nature Cancer, 2024.

[2]Chowell D, Yoo S K, Valero C, et al. Improved prediction of immune checkpoint blockade efficacy across multiple cancer tyPEs[J]. Nature Biotechnology, 2022, 40(4): 499-506.

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本文作者丨谭硕